Marc Seper startete seine berufliche Laufbahn im Infrastrukturbereich bei via donau. 2012 wechselte der gebürtige Oberwarter ins Burgenland und wurde Geschäftsführer der Diakonie Südburgenland GmbH. Nach acht Jahren folgte der heute 38-jährige dem Ruf der Gesundheit Burgenland und übernahm die Funktion des Kaufmännischen Direktors des Krankenhauses Güssing. Im Jahr 2023 wurde Seper zum Kaufmännischen Direktor der Klinik Oberwart bestellt. Herzstück seiner bisherigen Tätigkeit in der Gesundheit Burgenland war die Übersiedlung und Inbetriebnahme der neu gebauten Klinik Oberwart im Frühjahr 2024.