FH-Prof. DI Dr. Martin Zauner ist derzeit Beiratsmitglied im Bundesministerium für Gesundheit, Mitglied im österr. Abgrenzungs- und Klassifizierungsbeirat für Medizinprodukte, Mitglied der Spiegelgruppe MP-Regulation zur Vorbereitung des Standpunktes Österreich für die Verhandlungen der neuen MP-Verordnung auf europäischer Ebene. Außerdem ist er Sachverständiger für Medizinprodukte-Software des Landesgerichts Linz, Projektmanager am Austria Standards Institut (Österreichisches Normungsinstitut), Mitglied im Komitee Medizinische Informatik K238, Mitglied im Komitee Medizinische Informatik K238. Zudem ist er Arbeitsgruppenmitglied, MDEG Q&C of Medical Device Software MEDDEV 2.1/6 der Europäischen Kommission.